Santorini yra prieinamas strateginis žaidimas, pakankamai paprastas pradinės mokyklos klasei, tačiau siekiantis suteikti žaidimo gylį ir turinį, kurį gali tyrinėti hardcore žaidėjai. Taisyklės yra paprastos. Kiekvienas ėjimas susideda iš 2 žingsnių:
1. Judėti - perkelkite vieną iš savo statybininkų į gretimą erdvę. Galite perkelti savo statybininko figūrėlę tuo pačiu lygiu, pakilti vienu lygiu arba nusileisti bet kokiu lygiu.
2. Statyti - Tada pastatykite pastato lygį šalia statybininko, kurį perkeliate. Statydami ant trečio lygio, vietoj to padėkite kupolą, pašalindami tą erdvę iš žaidimo.
Laimėjimas žaidime - Jei bet kuris iš jūsų statybininkų pasiekia trečią lygį, jūs laimite.
Kintamos žaidėjų galios - Santorini siūlo kintamas žaidėjų galias, sluoksniuotas ant kitaip abstraktaus žaidimo, su daugeliu teminių dievų ir herojų galių, kurios fundamentaliai keičia žaidimo eigą.